Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-204ENST00000461668 793 ntTSL 519.71■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 219.13■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 518.59■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.53■□□□□ 0.565e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 218.12■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-206ENST00000485261 792 ntTSL 318.08■□□□□ 0.485e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 317.66■□□□□ 0.425e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 417.39■□□□□ 0.375e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 217.05■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CHERP-202ENST00000544299 1755 ntTSL 216.84■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 316.67■□□□□ 0.264e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-215ENST00000490986 977 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-214ENST00000490483 861 ntTSL 516.59■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 416.56■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-204ENST00000468294 501 ntTSL 216.23■□□□□ 0.195e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 216.21■□□□□ 0.195e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 216.19■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 315.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 215.35■□□□□ 0.055e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ITGA5-202ENST00000435631 1240 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.135e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EMD-209ENST00000494443 765 ntTSL 214.2□□□□□ -0.145e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 213.66□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ITGA5-211ENST00000552564 4996 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 14.5
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PUM1Q14671 ANKLE2-206ENST00000538766 1557 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 313.1□□□□□ -0.315e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 14.5
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PUM1Q14671 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 313.04□□□□□ -0.324e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.77□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.415e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 BUB3-204ENST00000407911 895 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF3G-205ENST00000587993 555 ntTSL 312.34□□□□□ -0.431e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-7■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 412.1□□□□□ -0.475e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-209ENST00000471323 3326 ntTSL 212.09□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.535e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-204ENST00000409322 797 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 AL627309.8-201ENST00000595919 284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PRMT1-206ENST00000526224 578 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-203ENST00000409167 1372 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 HDLBP-234ENST00000471294 490 ntTSL 411.42□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DCAF7-203ENST00000580091 325 ntTSL 311.29□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-206ENST00000409495 1014 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-203ENST00000505031 2861 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CRNKL1-204ENST00000490910 4183 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 510.54□□□□□ -0.722e-13■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 410.39□□□□□ -0.755e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 410.39□□□□□ -0.755e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 310.39□□□□□ -0.755e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 410.39□□□□□ -0.755e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 STMN3-205ENST00000634126 605 ntTSL 310.3□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-203ENST00000561971 799 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-205ENST00000462793 700 ntTSL 310.03□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14.5
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