Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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GBX1Q14549 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX1Q14549 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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