Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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UBE4AQ14139 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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UBE4AQ14139 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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UBE4AQ14139 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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UBE4AQ14139 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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UBE4AQ14139 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE4AQ14139 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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