Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms