Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OCA2Q04671 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OCA2Q04671 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OCA2Q04671 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OCA2Q04671 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms