Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms