Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP1Q00587 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms