Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms