Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPI1P60174 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPI1P60174 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPI1P60174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPI1P60174 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPI1P60174 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPI1P60174 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPI1P60174 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPI1P60174 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPI1P60174 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms