Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPAP53621 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPAP53621 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPAP53621 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPAP53621 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPAP53621 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPAP53621 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPAP53621 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPAP53621 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPAP53621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPAP53621 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPAP53621 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPAP53621 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPAP53621 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPAP53621 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPAP53621 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPAP53621 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPAP53621 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPAP53621 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPAP53621 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms