Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP2P32456 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP2P32456 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP2P32456 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP2P32456 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP2P32456 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms