Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP1P32455 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP1P32455 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP1P32455 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP1P32455 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP1P32455 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms