Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHA2P29317 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA2P29317 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA2P29317 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms