Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB5P28074 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB5P28074 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB5P28074 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB5P28074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB5P28074 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms