Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms