Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPAP23025 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPAP23025 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
XPAP23025 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPAP23025 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPAP23025 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPAP23025 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPAP23025 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPAP23025 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms