Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB1P16220 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB1P16220 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB1P16220 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB1P16220 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB1P16220 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms