Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms