Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms