Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTMAP06454 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTMAP06454 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTMAP06454 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTMAP06454 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTMAP06454 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTMAP06454 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTMAP06454 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTMAP06454 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTMAP06454 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms