Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNKO75909 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNKO75909 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNKO75909 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNKO75909 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms