Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms