Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.961e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 520.9■□□□□ 0.941e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 520.51■□□□□ 0.871e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 520.08■□□□□ 0.811e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 320.05■□□□□ 0.81e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.181e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 49.81□□□□□ -0.841e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.291e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-208ENST00000532940 1782 ntTSL 1 (best)24.52■■□□□ 1.527e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-210ENST00000533846 1623 ntTSL 1 (best)23.41■■□□□ 1.347e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-206ENST00000530347 1037 ntTSL 518.49■□□□□ 0.557e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.397e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 217.28■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.726e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-211ENST00000530340 1876 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.966e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.126e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-204ENST00000393352 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 414.54□□□□□ -0.081e-9■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.775e-7■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 TNFRSF1A-208ENST00000536194 581 ntTSL 310.7□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.218e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.638e-8■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.548e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.68e-8■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 MGST2-206ENST00000515137 1013 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 ASL-209ENST00000493708 885 ntTSL 324.36■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 314.87□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.77e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 310.92□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 HNF1A-204ENST00000535955 434 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.655e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 520.44■□□□□ 0.869e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 09e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 311.62□□□□□ -0.559e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.699e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 57.71□□□□□ -1.181e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.219e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.693e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.693e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.463e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 TOMM40-205ENST00000589649 731 ntTSL 223.3■■□□□ 1.323e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CTDSP1-211ENST00000492545 634 ntTSL 522.58■■□□□ 1.213e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 422.57■■□□□ 1.23e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.983e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 520.43■□□□□ 0.863e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 UBL5-204ENST00000588595 546 ntTSL 220.08■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 UBL5-203ENST00000588141 573 ntTSL 420.08■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.473e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 24.7
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