Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC5O15511 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms