Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms