Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF28PB7ZC32 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF28PB7ZC32 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms