Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD3A2A2Y4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms