Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PALM2-201ENST00000314527 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PIMREG-206ENST00000572595 1551 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RPSAP46-201ENST00000428316 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC004585.2-201ENST00000624090 1473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms