Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NICN1Q9BSH3 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NICN1Q9BSH3 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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