Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms