Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
DEFB1P60022 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
DEFB1P60022 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms