Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SCN2BO60939 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCN2BO60939 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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