Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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