Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DOLKQ9UPQ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DOLKQ9UPQ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms