Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDZRN3Q9UPQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms