Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms