Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN3Q9P232 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms