Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXXC1Q9P0U4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms