Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C9orf78Q9NZ63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf78Q9NZ63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms