Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL39Q9NYK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL39Q9NYK5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms