Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BARHL2Q9NY43 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms