Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDHAF2Q9NX18 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDHAF2Q9NX18 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SDHAF2Q9NX18 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDHAF2Q9NX18 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDHAF2Q9NX18 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDHAF2Q9NX18 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDHAF2Q9NX18 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms