Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNAU1APQ9NX07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNAU1APQ9NX07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms