Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM28Q9NW13 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms