Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH12Q9NPG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms