Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms