Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT23Q9C075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms