Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC11CQ9BY50 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms