Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM109Q9BVC6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM109Q9BVC6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms