Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UIMC1Q96RL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms